Les entéropathies inflammatoires chroniques sont des affections complexes, marquées par diverses manifestations cliniques et biologiques. Le déséquilibre du microbiote intestinal a été reconnu comme un facteur clé dans ces atteintes. Les traitements actuels ne parviennent pas toujours à rétablir cet équilibre à moyen ou long terme, ni à offrir une qualité de vie satisfaisante aux chiens concernés. La transplantation de microbiote fécal apparaît ainsi comme une approche innovante pour restaurer cet équilibre microbien. Nous avons étudié l’évolution des fonctions microbiennes chez des chiens atteints d’entéropathie inflammatoire chronique, qui ont montré une amélioration clinique suite à la transplantation de microbiote fécal. Une amélioration cinique a été observée chez 65 % des chiens, accompagnée d'une augmentation des concentrations fécales de propionate et d'acétate, ainsi que des acides biliaires secondaires, et d'une réduction de l'activité protéolytique fécale. Cette étude fournit la preuve que la transplantation de microbiote fécal peut améliorer la condition clinique, en parallèle d'une amélioration des fonctions microbiennes. Des études supplémentaires corrélant ces résultats avec l'évolution de la composition microbienne sont nécessaires à l'avenir.